MLPH表达对乳腺癌预后影响的生物信息学分析

时间：2023-01-17 16:35:25　来源：天一资源网本文已影响人

张文静，林云勇，陈锐，邱少东，陈菲

（广州医科大学附属第二医院超声科，广东广州 510260）

乳腺癌（breast cancer）是女性常见的恶性肿瘤，早期筛查对于降低其死亡率至关重要[1]。雌激素受体（estrogen receptor，ER）、孕激素受体（progesterone receptor，PR）和人表皮生长因子受体-2（HER-2）等虽已应用于临床诊断，但无法直接用于预测预后[2]。目前，关于乳腺癌侵润、转移的详细机制研究较少[3，4]。MLPH与乳腺癌患者的化疗反应和预后相关，但其表达与预后的具体关系有待进一步研究。本研究拟通过多个在线数据库进行综合生物信息学分析，分析MLPH基因表达与乳腺癌预后之间的关系，现报道如下。

基于Oncomine数据库分析乳腺癌及癌旁组织中MLPH的mRNA表达水平差异；
基于Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析不同亚型乳腺癌患者中MLPH的mRNA表达差异；
基于UALCAN数据库分析及评估乳腺癌患者中MLPH的蛋白表达情况。基于PrognoScan数据库分析MLPH基因的表达与乳腺癌患者生存率的关系；
通过Kaplan-Meier数据库计算总生存期（OS）、无远处转移生存期（DMFS）、无复发生存期（RFS）和进展后生存期（PPS），并评估MLPH表达与乳腺癌患者预后的关系。使用Kaplan-Meier数据库评估MLHP蛋白表达与预后之间的关系，使用R语言进行基因集富集分析。

2.1 MLPH在乳腺癌中的表达情况 MLPH在导管内筛状腺癌、乳腺小叶和导管混合癌、乳腺浸润性小叶癌中呈高表达，见图1A、1 B、1 C；
MLPH蛋白在乳腺癌组织中呈高表达，见图1D。

图1 MLPH mRNA和蛋白在乳腺癌患者和癌旁组织中的表达比较

2.2 MLPH基因表达与临床指标的关系通过Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析MLPH表达与年龄、SBR、ER、PR、HER-2、淋巴结状态、基底样状态及三阴性状态间的关系发现：与＞51岁组相比，≤51岁组的MLPH表达显著降低；
Scarff-Bloom-Richardson（SBR）是一种评估肾小管形成、细胞核多形性特征和有丝分裂指数的组织学分级，SBR分级更高的乳腺癌患者的MLPH基因有着更高的表达；
雌激素受体（ER）和孕酮受体（PR）状态与MLPH表达呈负相关；
淋巴结阴性（N）的乳腺癌患者的MLPH水平高于淋巴结阳性患者。此外，非基底样亚型的乳腺癌患者及三阴性乳腺癌（TNBC）患者的MLPH表达显著升高。

2.3 MLPH高表达与乳腺癌预后的关系 MLPH高表达的乳腺癌患者有着较高的OS、DMFS、RFS和PPS，见图2A、2 B、2 C、2 D；
MLPH蛋白的高表达与患者5年总生存期密切相关，见图2E。通过GSEA进行KEGG通路富集分析，显示MLPH与G蛋白偶联受体（G Protein-Coupled Receptors，GPCR）信号通路密切相关，见图2F。

图2 MLPH高表达与乳腺癌预后的关系

乳腺癌的发生发展过程与癌基因的异常表达密切相关，新的生物标志物的识别对其诊断、治疗及预后至关重要[5，6]。MLPH编码人体内的一种载体蛋白-亲黑素，是一种Rab效应蛋白，可以与Ras相关的GTP酶、Rab27A、Rab27B和运动蛋白肌球蛋白相互作用[7，8]。直接揭示MLPH在乳腺癌中的特定生物学功能的研究较少，但一些研究表明[9，10]，MLPH与乳腺癌较好的化疗反应和良好的生存预后显著相关，且MLPH还被认为是与预后相关的生物标志物。另一项研究表明[11]，MLPH在前列腺癌中的表达受AR的调控，并且MLPH的基因序列含有一个AR结合位点。然而，MLPH表达在乳腺癌预后中的意义尚不清楚，本研究通过多数据联合进行生物信息学分析，揭示了MLPH是一种与乳腺癌预后相关的潜在预测生物标志物。

本研究通过Oncomine数据库分析了MLPH在乳腺癌数据库中的表达。MLPH在导管内筛状乳腺癌，乳腺小叶和导管混合癌，乳腺浸润性小叶癌中的表达明显高于癌旁组织。Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示，ER、PR和SBR分级、基底样状态和三阴性状态与MLPH表达呈负相关。然而，与正常组织相比，年龄和淋巴结状态与乳腺癌样本中的MLPH水平呈正相关。这些结果表明了MLPH的表达可以预测乳腺癌的预后。本研究使用Kaplan-Meier Plotter、PrognoScan和Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库进一步研究了MLPH在乳腺癌中的预后价值。MLPH表达增加的患者表现出更高的OS、RFS、DMFS和DFS。上述结果均表明了MLPH的表达可能是与乳腺癌预后相关的预测生物标志物。GSEA分析揭示了乳腺癌中富含GPCR信号通路的MLPH的功能。

综上所述，MLPH可作为乳腺癌预后的重要生物标志物，其在乳腺癌治疗中具有重要潜在临床价值，作用机制可能与GPCR信号通路密切相关。

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